Publication: Tangbook: herramienta analítica y de visualización para datos metabolómicos
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Authors
Abstract (Spanish)
Este proyecto tiene como objetivo desarrollar una herramienta de análisis de datos metabolómicos utilizando bases de datos generalizadas preexistentes. Recientemente, la metabolómica se ha vuelto relevante debido a su prometedora contribución al diagnóstico de enfermedades y la identificación de tratamientos. Sin embargo, los datos metabolómicos plantean un desafío debido a la gran cantidad de datos generados a partir de muestras biológicas de pacientes, lo que dificulta los análisis para médicos e investigadores. Por lo tanto, los investigadores de diferentes campos requieren herramientas bioinformáticas para procesar datos de manera rápida y confiable. Este proyecto utilizará datos metabolómicos sin procesar de pacientes con encefalopatía metabólica y arritmias relacionadas, afectados por TANGO2-RMEA. TANGO2-RMEA es una enfermedad genética rara descubierta recientemente causada por variantes patogénicas en el gen TANGO2. El mecanismo metabólico subyacente que conduce a los síntomas graves en TANGO2-RMEA no se comprende bien. El análisis tiene como objetivo ayudar a los médicos e investigadores a comprender mejor el defecto en los pacientes TANGO2-RMEA, lo que genera hipótesis que los médicos genetistas y otros especialistas explorarán en detalle, con el objetivo final de encontrar estrategias de tratamiento para esta afección.
Abstract (English)
The project aims to develop a new metabolomic
data analysis tool using preexisting widespread metabolomic da-
tabases. Recently, metabolomics has become more relevant due to
its promising contribution to diagnosing diseases and identifying
treatments. However, metabolomic data poses a challenge due
to the vast amount of data generated from patients’biological
samples, making analyses difficult for clinicians and researchers.
Therefore, investigators from different fields require bioinforma-
tic tools to process metabolomic data quickly and reliably. This
project will utilize raw metabolomic data from patients affected
by TANGO2 Related Metabolic Encephalopathy and Arrhythmias
(TANGO2-RMEA) as a patient sample pilot. TANGO2-RMEA is a
recently found rare genetic disease caused by pathogenic variants
in the TANGO2 gene. The underlying metabolic mechanism
leading to the severe symptoms in TANGO2-RMEA is not well
understood. The analysis aims to help physicians and researchers
better understand the defect in the TANGO2-RMEA patients,
leading to hypotheses to be explored in detail by medical
geneticists and other specialists, with the ultimate goal of finding
treatment strategies for this condition.
Director
Advisors/Directors
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47 páginas
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Ojeda Ávila, Johana Constanza. (2022). Tangbook: herramienta analítica y de visualización para datos metabolómicos.
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Ojeda Ávila, Johana Constanza.. "Tangbook: herramienta analítica y de visualización para datos metabolómicos." 2022.
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Ojeda Ávila, Johana Constanza.. 2022. "Tangbook: herramienta analítica y de visualización para datos metabolómicos."